Sélection du tableau
Pour choisir le tableau où se déroule le combat, positionnez-vous sur Sonia. Ensuite, appuyez par en haut avec le control pad et start. Choisissez votre combattant et vous pourrez ensuite choisir le lieu du combat.

Jouer avec Shao Kahn
Pour jouer avec Shao Kahn, choisissez un personnage. Avant que le combat commence, appuyez et maintenez High punch, low punch et en bas sur le control pad. Ce code fonctionne seulement aux tableaux suivants : The Kave, Pit 3, Rooftop.

Jouer avec Motaro
Pour jouer avec Motaro, choisissez un personnage. Avant que le combat commence, appuyez et tenez High Kick, Low Kick et par en arrière sur le control pad. Ce code fonctionne seulement pour ces deux tableaux : Balcony et Jade's desert.

Jouer avec Smoke (humain)
Pour jouer avec la version humaine de smoke, choisissez smoke (robot). Avant que le combat commence, appuyez et maintenez High Kick, High Punch, Run, Block et par en arrière sur le control pad.

Selection au hasard
Pour sélectionner un personnage au hasard, positionnez-vous sur Noob Saibot pour le joueur #1 ou Rain pour le joueur #2. Appuyez ensuite par en haut sur le control pad et start.

Options secrètes #1

Pour avoir accès à ce menu, attendez l'introduction où un texte explique l'histoire de Mortal Kombat. Appuyez rapidement sur : High Kick, Low Kick, High Punch, Low Punch, High Kick, Low Kick, High Punch, Low Punch, Block, Run. Si le code a été bien fait, vous entendrez "Outstanding".
Allez ensuite sélectionner le point d'interrogation dans le menu des options et le tour est joué.

Options secrètes #2

Pour avoir accès à ce menu, attendez l'introduction où un texte explique l'histoire de Mortal Kombat. Appuyez rapidement sur : High Punch, High Kick, Low kick, Low Punch, Run, Block, Block, Block, Run, Run. Si le code a été bien fait, vous entendrez une voix. Il ne vous reste plus qu'à aller sélectionner le point d'interrogation rouge dans le menu des options.

Baby Mode
Pour avoir de minuscules joueurs, attendez l'écran Tonight's Matchup et entrez le code 025 avec les boutons A, C (en bas) et C (à droite).

Stealth Turbo
Dans un match à deux joueurs ou plus, faites le code 273 à l'écran Tonight's Matchup à l'aide des boutons A, C (en bas) et C (à droite).

Jouer sur le toit
Pour jouer sur le toit d'un immeuble, appuyez et maintenez à gauche sur le control pad tout en appuyant trois fois sur turbo lorsque l'écran de sélection des équipes change pour celui du Tonight's Matchup.

Block Power
Pour augmenter les performances d'un joueur pour bloquer les paniers, faites le code 616 à l'écran Tonight's Matchup à l'aide des boutons A, C (en bas) et C (à droite).

Goal Tending
Pour rendre les goal tending légaux, faites le code 937 à l'écran Tonight's Matchup à l'aide des boutons A, C (en bas) et C (à droite).

Pas de bousculade
Pour empêcher tout le monde de pousser tout le monde, faites le code 390 à l'écran Tonight's Matchup à l'aide des boutons A, C (en bas) et C (à droite).

Pas de musique
Pour couper la musique (pas les effets sonores), faites le code 048 à l'écran Tonight's Matchup à l'aide des boutons A, C (en bas) et C (à droite).

Turbo illimité
Pour avoir du turbo power à l'infini, faites le code 461 à l'écran Tonight's Matchup à l'aide des boutons A, C (en bas) et C (à droite).

Hyperspeed
Pour avoir des joueurs qui courent à toute vitesse, faites le code 552 à l'écran Tonight's Matchup à l'aide des boutons A, C (en bas) et C (à droite).